الإفراط في تناول البطيخ قد يسبب الإسهال والانتفاخ وارتفاع سكر الدم لدى بعض الأشخاص كما قد يؤدي سوء حفظه إلى التسمم الغذائي لذلك ينصح بالاعتدال واتباع قواعد النظافة.